WinSetter permette di accedere, in maniera grafica, alle impostazioni nascoste di Windows e di modificarle in base alle esigenze. Dall'interfaccia principale del programma è possibile accedere direttamente alle varie voci:
- aggiunta e rimozione programmi;
- prompt di ms-dos;
- impostazioni di Internet Explorer;
- impostazioni desktop;
- voci registro;
- menu start;
- impostazioni Outlook Express;
- registro eventi;
- impostazioni di sistema;
- impostazioni taskbar.