PDF-Shuffler è un software open source per ambienti operativi GNU/Linux dedicato alla gestione di documenti in formato PDF. In particolare il suo obiettivo non è tanto quello di permetterne la visualizzazione, quanto piuttosto la modifica ed l'organizzazione: una volta scelto un documento PDF tramite l'apposita interfaccia grafica, infatti, è possibile selezionarne specifiche pagine da estrarre, effettuare operazioni di taglia e incolla per modificare tale file secondo le proprie esigenze, effettuare il merge di più documenti così da ottenere un unico PDF di semplice gestione ed eseguire in generale un ampio range di operazioni per ottenere nuovi documenti modificati, attraverso tool facilmente accessibili.
L'applicazione si presenta nel complesso leggera ed efficiente, con un'interfaccia grafica studiata per essere semplice da utilizzare e intuitiva anche per i meno esperti. Trattasi dunque di un'utility di assoluto valore che può risolvere diverse situazioni problematiche.